Vertiefungsrichtung Computational Biology

Die moderne Biologie ist heute eine quantitative Wissenschaft, aus deren Zentrum computergestützte Methoden zur Informationsanalyse, Simulation und Vorhersage nicht mehr wegzudenken sind. Neuartige experimentelle Methoden erlauben es, routinemässig vollständige Genome zu sequenzieren oder biologische Systeme aus verschiedenen Perspektiven automatisch und quantitativ zu charakterisieren.

Mittels rechnergestützter Methoden wird versucht, diese Flut an Daten zu analysieren, die unterliegenden Bauprinzipien und wechselseitigen Regulationsmechanismen zu erkennen. Das quantitative Studium biologischer Prozesse von der molekularen über zelluläre Dimensionen bis zum gesamten Organismus bildet die Grundlage zum Verständnis biologischer Prozesse. In Kombination mit der Simulation dieser Prozesse strebt die Computational Biology danach, das ganze Netzwerk der biologischen Prozesse zu verstehen, und z. B. für die Behandlung von Krankheiten nutzbar zu machen.

Dieser neue Fokus in der Ausbildung eröffnet den AbsolventInnen Perspektiven in Bereichen der Computational Biology, Bioinformatik, Biophysik, Systembiologie, Molekular- und Strukturbiologie.

Beispielstundenpläne des 3. bis 6. Semesters

Forschung

• Forschungsgruppe von Prof. Mihaela Zavolan
  Rolle kleiner RNAs bei der Regulation der Genexpression

• Forschungsgruppe von Prof. Torsten Schwede
  Bioinformatik und Proteine in 3D: Sequenz – Struktur – Funktion

• Forschungsgruppe von Prof. Erik van Nimwegen
  Funktion und Evolution genomweiter Regulationsnetzwerke

Testimonial from a PhD student in Computational Systems Biology
PhD Candidate Đorđe Relić on his graduate student experience at the Biozentrum of the University of Basel.
Visit on youtube.

• Forschungsgruppe von Prof. Richard Neher
  Evolution von Viren und Bakterien

Richard Neher gewinnt Open Science Prize
Prof. Richard Neher vom Biozentrum der Universität Basel hat gemeinsam mit Prof. Trevor Bedford vom Fred Hutchinson Cancer Research Center in Seattle den Open Science Prize gewonnen. Die beiden Wissenschaftler erhalten die Auszeichnung für ihr öffentliches Online-Tool «nextstrain.org», mit dem sich die Evolution und Ausbreitung von Krankheitserregern wie Ebola oder Zika in Echtzeit überwachen lässt.
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